菌落采样是生命科学实验中最基础也最高频的操作之一。七十年来,这项技术经历了六次重大进化:从1950年代的手工牙签和接种环,到1990年代人类基因组计划催生的自动化金属Pin,再到一次性针头、连续聚合物丝切割、激光微流控,直至2023年出现的采样球投入式转移技术。六代技术的演化遵循同一主线——不断缩短"采样工具后处理"的时间。第六代采样球方案通过将采样介质与菌落一起投入培养液,从根本上消除了这一环节,实现了综合工况速度的数量级突破。
在生命科学实验中,有一个看似简单却至关重要的操作:从培养皿的琼脂表面上,把一个肉眼勉强可见的细菌菌落,精准地转移到另一个容器的培养液中。
这个动作,微生物学家们每天重复成百上千次。七十多年来,它所使用的工具和方法经历了六次重大进化——每一次进化都在解决同一个核心问题:如何更快、更准、更干净地完成菌落的采样与转移。
我们试图用一篇文章,把这六代技术的来龙去脉梳理清楚。不做评判,只做记录。让我们从一根牙签开始。
最原始也最经典的方式。实验员坐在超净台前,一手持灭菌牙签或铂金接种环,另一手固定培养皿,在酒精灯旁边小心翼翼地挑取单个菌落,转移到试管或孔板中。
铂金接种环可以通过酒精灯火焰灼烧灭菌后重复使用;一次性塑料接种环和灭菌牙签则用完即弃。有些实验室甚至会将灭菌牙签直接丢入液体培养管中,让牙签和菌落一起留在培养液里——这是"采样工具随样转移"概念的最原始雏形。
速度:~300个/小时(熟练操作员)高度依赖人工,疲劳误差大
代表工具:铂金接种环、一次性塑料接种环、灭菌牙签、灭菌竹签
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随着人类基因组计划(HGP)的推进,菌落挑选的通量需求爆发式增长。手工操作已经无法满足每天数万个菌落的挑选需求,自动化菌落挑选器应运而生。
这一代的核心思路是:用机器人代替人手,用金属针头代替牙签。设备通过CCD相机拍摄培养皿图像,软件自动识别菌落位置,然后由机械臂驱动金属针头(通常为钨合金材质,96根并行)精准蘸取菌落,转移到96孔目标板中。
为解决交叉污染问题,金属针头在每次挑菌后需经过完整的清洗消毒流程:多次乙醇浸泡→卤素灯高温烘干→冷却等待。这套消毒流程保证了针头重复使用的安全性,但也成为了速度瓶颈——每个周期中约62%的时间花在清洗消毒上。
标称速度:~3,000个/小时清洗消毒:6次乙醇清洗+卤素灯综合工况速度大幅低于标称值
代表产品:美国Molecular Devices QPix系列(1990s至今,全球装机超600台)
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第二代的清洗消毒流程虽然有效,但始终存在隐患:清洗不彻底就会交叉污染。于是行业的另一个流派诞生了——干脆不洗,用完就丢。
这一代设备用一次性针头或塑料吸头代替可重复的金属Pin。每挑一个菌落就换一根新针头,从根源上杜绝交叉污染。SCARA机器人配合自动退针机构,可以在完成一次挑菌后自动退掉旧针头、安装新针头。
代价是耗材成本大幅上升,且退针换针的机械动作同样需要时间。有的设备采用移液枪头直接吸取菌悬液,但通量较低。
零交叉污染(一次性使用)耗材成本高退针/换针耗时
代表产品/方案:中国专利CN213529686U(一次性针头+SCARA机器人)、美国Hudson RapidPick Harvester(移液枪头式)、德国Sartorius PrecisionTips
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英国Singer Instruments提出了一个巧妙的折中方案:既不反复清洗同一根针,也不逐个更换独立的一次性针头,而是用一卷连续的聚合物丝,每次切出一个新的端面。
这种被称为PickupLine™的耗材,是一根直径1mm的特制聚合物挤出丝,以200米长卷的形式装入设备。每次挑菌前,设备内部的精密刀片将聚合物丝切出一个全新的洁净切面,用这个切面去蘸取菌落并转移。一卷200米的聚合物丝可以产生超过33,000个一次性采样端面。
这个设计巧妙地平衡了成本和无菌性——耗材成本远低于独立的一次性针头,同时每次都用全新切面,不需要清洗。但本质上仍然是"点接触+接触转移"的模式。
速度:~3,000个/小时一次性新切面,无需清洗耗材成本低(一卷做33,000次)仍为点接触,仍需"脱离"步骤
代表产品:英国Singer Instruments PIXL / PIXL Max(全球超1,000台装机,覆盖60个国家)
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如果说前四代技术都在解决"用什么工具接触菌落"的问题,那么第五代技术则完全跳出了这个框架——它根本不接触菌落。
中国科学院青岛生物能源与过程技术研究所开发的Digital Colony Picker,采用微流控芯片替代传统培养皿,将单个微生物细胞隔离在16,000个皮升级微腔室中。通过AI图像识别锁定目标后,使用激光诱导气泡技术"隔空取物",将目标微生物以微液滴形式导出。
这是目前最前沿的技术路线,具有单细胞分辨率、零污染等优势。但它需要专用微流控芯片(成本高),不兼容传统培养皿,且通量相对有限,目前更适合科研探索而非工业化生产。
零污染(非接触式)速度:~1,000个/小时不兼容传统培养皿芯片成本高
代表产品:Digital Colony Picker(中科院青岛能源所/青岛星赛生物,2025年发表于Nature Communications)
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回顾前五代技术,会发现一个有趣的规律:它们都在不同程度上受困于同一个问题——"采样工具与菌落的分离"。
第一代用手拔出牙签,第二代用消毒洗掉残留,第三代用退针弹掉旧针,第四代用刀片切掉旧端面,第五代干脆不用物理工具。无论哪种方式,"分离"这个环节都消耗着时间或成本。
第六代技术走了一条完全不同的路:不分离。
采样球投入式转移技术,使用一颗经过8道工序灭菌处理的微型球体(直径约2mm),通过气动吸笔吸取后,球面蘸取培养皿中的菌落,然后将采样球连同菌落一起直接投入目标培养液中。球留在液体里,不需要取出,不需要清洗,不需要任何后处理。释放一颗球,立即吸取下一颗新球,中间零等待。
这个思路乍看简单甚至"粗暴"——但它从根本上消除了困扰前五代技术的速度瓶颈。当62%的周期时间(清洗消毒)被归零,速度的数量级飞跃就自然发生了。
配套的飞拍检测系统可以在每次采样前对采样球进行四重质量预检(吸取确认、完整性检测、洁净度检测、影像追溯),双二维码信息匹配系统实现精准对应采样——这些都是前五代技术不需要、也不存在的全新需求。
采样球已发展出多种材质:玻璃球(磨砂表面,增加菌体附着量)、钢球(密度高,沉入稳定)、可溶性球(溶解后不留残留),不同客户根据生物学需求选择。
综合工况速度:≥3,000个/小时(经SAT验收)一次性使用,零交叉污染耗材成本极低
代表产品:中国青岛工发智能 二代菌落采样工作站(已获多家头部基因合成企业采购并通过SAT验收,已申请国内发明专利及PCT国际专利)
六代技术全景对比
| 世代 | 核心方案 | 时代 | 采样工具去向 | 速度瓶颈 | 综合速度 |
|---|
| I | 手工牙签/接种环 | 1950s | 火焰灼烧/丢弃 | 人工操作 | ~300/h |
| II | 可重复金属Pin | 1990s | 清洗消毒后重复使用 | 清洗消毒(~78秒/周期) | 标称3,000/h |
| III | 一次性针头/吸头 | 2000s | 退针丢弃 | 退针换针 | 未公开 |
| IV | 聚合物丝切割 | 2010s | 切掉丢弃 | 送丝切割 | ~3,000/h |
| V | 激光微流控 | 2020s | 无物理介质 | 芯片通量 | ~1,000/h |
| VI | 采样球投入式 | 2023 | 留在培养液中 | 无(零后处理) | ≥3,000/h(综合) |
六代技术的演进逻辑
纵观六代技术,可以清晰地看到一条演化主线:行业一直在寻找更好的方式来解决"采样工具的后处理"问题。
第I代:人工火焰灼烧 → 第II代:机器自动清洗消毒 → 第III代:不洗了,直接换新的 → 第IV代:不换独立的针头,切一段新丝面 → 第V代:不用物理工具了 → 第VI代:用物理工具,但不取回来。
每一代都在试图缩短"后处理"的时间。第六代的突破在于——它不是把后处理做得更快,而是让后处理这个概念本身消失了。
从牙签到采样球:一个关于"不起眼的工具"的故事
回望这七十年的技术演化,最令人感慨的或许是:推动变革的从来不是多么复杂的理论突破,而是对一个朴素问题的反复追问——"能不能再简单一点?"
第一代技术的牙签法中,有些实验员习惯把蘸了菌落的牙签直接丢进培养管里——这个最"偷懒"的操作方式,无意中成为了第六代采样球技术的思想原型。只不过,从"手动扔牙签"到"机器人自动投放经过8道工序灭菌的采样球",中间隔了七十年和五代技术的积累。
"最好的工具,是你忘记它存在的那种。
采样球进入培养液的那一刻,工具就消失了。
消失,就是它最好的状态。"
菌落采样技术的进化还在继续。也许未来会有第七代、第八代。但无论技术如何演进,核心目标始终没有改变:更快、更准、更干净地把一个菌落从这里送到那里。
六代技术,七十年求索,为的不过是这一件小事。
参考资料:本文中各代技术的产品信息和参数数据来源于相关厂商公开发布的产品手册、学术论文及专利文献,包括但不限于:Molecular Devices QPix Colony Picking Series Brochure、Singer Instruments PIXL Specifications、Nature Communications (2025) AI-powered Digital Colony Picker、中国专利CN213529686U、中国专利CN117305088A等。本文旨在客观梳理行业技术演化历程,不代表对任何特定产品的评价。
关于青岛工发智能科技有限公司
青岛工发智能科技有限公司专注于生命科学自动化设备的研发与制造,是全球首家采用"采样球投入式转移"技术路线的菌落采样设备制造商。公司拥有多项发明专利及PCT国际专利申请,产品服务于国内外多家知名生命科学企业和科研机构。
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